ANÁLISE DE
MICROBIOMA
ORAL
O Microbioma Oral compreende a complexa comunidade de microrganismos que habitam nossa cavidade oral, bem como seus genomas e o ambiente em seu entorno. Possui grande importância na manutenção da saúde bucal e na proteção contra patógenos.
Na BiomeHub possuímos experiência em projetos de análise de microbioma oral.
Nossos processos são validados, desde a preparação de amostras até o sequenciamento e a entrega de dados, seguindo um rigoroso monitoramento da qualidade dos ensaios.
Pesquisas com microbioma oral podem incluir a investigação de:
Associações com o desenvolvimento de condições como, por exemplo, cáries, gengivite, periodontite, halitose, entre outras.
Biomarcadores prognósticos.
Resposta a drogas.
Desenvolvimento de moléculas terapêuticas.
Estratégias de intervenção.
SERVIÇOS DISPONÍVEIS PARA PESQUISA DE MICROBIOMA ORAL
Aconselhamos sobre a melhor maneira de coletar, armazenar e enviar suas amostras.
Realizamos extração de DNA de amostras de microbioma oral, sob condições controladas e rastreáveis.
Preparação das amostras
Veja os tipos de amostras aceitas
Material fornecido pela BiomeHub:
- Kit de coleta simplificado para Microbioma Oral
Material coletado pelo cliente:
- Amostras de DNA já extraído*.
*Amostras de DNA já extraído devem ser preferencialmente congeladas (-20ºC a -80ºC), com concentração maior que 1 ng/uL (Qubit), em no mínimo 20 uL, com razão A260/280 entre 1.8 e 2.0, e sem EDTA no tampão de eluição.
Oferecemos sequenciamento de amplicons do gene 16S rRNA.
Sequenciamento
Amplicons do gene 16S rRNA
O sequenciamento de amplicon 16S rRNA é uma das aplicações mais amplamente utilizadas para investigar a microbiota em qualquer local do corpo.
Pode ser utilizado em pesquisas clínicas e pré-clínicas para:
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Caracterização de populações bacterianas
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Análise taxonômica
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Identificação de espécies bacterianas
Parâmentros do sequenciamento: o sequenciamento 16S (região V3-V4) é realizado usando a plataforma Illumina, single-end, com 300 pb.
Análises de dados: possuímos um pipeline de bioinformática para 16S, e os resultados liberados podem ser personalizados para atender às suas necessidades:
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Dados brutos (fastq);
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Tabela com total de reads por classificação taxonômica;
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Tabela de perfil microbiológico lowest (LCA);
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Tabela com valores de alfa-diversidade;
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Tabela de contagem de oligotipos (ASV) e Tabela taxonômica;
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Gráfico de perfil microbiológico;
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Gráfico de beta-diversidade;
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Sumário da análise.
Coleta de amostras
