BIOINFORMÁTICA robusta para acelerar suas descobertas.
O grande volume de dados gerados pelos sequenciamentos de DNA de alto desempenho exige análises computacionais complexas e rigorosas.
Mais do que executar pipelines, a BiomeHub atua como o seu hub central de inteligência: você fornece os dados brutos de sequenciamentos (FASTQ) e as informações do seu experimento (metadados), e nossa equipe multidisciplinar especializada garante o processamento de dados, controle de qualidade e a avaliação estatística, assegurando a rastreabilidade e a credibilidade dos seus resultados.
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Pipelines validados para dados de sequenciamento de microbioma
Desenvolvemos nossas análises com ferramentas amplamente validadas pela comunidade científica, garantindo resultados reprodutíveis e alinhados às melhores práticas em bioinformática.
Análise de Amplicons (16S e ITS):
Caracterização da diversidade microbiana por meio do processamento no QIIME2 com denoising via DADA2 e inferência de variantes de sequência (ASVs) utilizando banco de dados público.
Metagenômica
por Shotgun:
Caracterização abrangente do microbioma e de seu potencial funcional por meio do pipeline bioBakery, com perfil taxonômico de alta resolução e anotação funcional.
Entregas analíticas e escopo estatístico
Adaptamos a avaliação estatística ao seu delineamento (comparação entre grupos biológicos, variáveis categóricas ou estudos longitudinais). Todas as análises incluem:
Diversidade Alfa:
Métricas de complexidade intra-amostra (Riqueza, Shannon, Simpson e Inverse Simpson).
Diversidade Beta:
Visualização de dissimilaridade via PCoA e NMDS, aplicando múltiplas matrizes de distância (Bray-Curtis, Euclidiana, Jaccard, UniFrac e UniFrac ponderada).
Dados Base:
Tabelas detalhadas de classificação taxonômica em diferentes níveis taxonômicos.
Abundância Diferencial:
Identificação de biomarcadores através de pacotes estatísticos avançados (DESeq2, Maaslin2, linDA, corncob e limma-voom).
Visualizações:
Gráficos e tabelas de alta qualidade para interpretação dos resultados e utilização em publicações científicas.
Diversidade alfa
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Soluções Personalizadas em Bioinformática
Seu projeto exige abordagens além dos pipelines metodológicos padrão ou você ainda está avaliando a melhor estratégia analítica para os seus dados? Compartilhe as perguntas biológicas e os objetivos do seu estudo conosco. Nossa equipe de especialistas desenhará um fluxo de bioinformática customizado para atender às necessidades específicas do seu delineamento experimental.
Vá além das planilhas estáticas com o EncodeReports
Apoiamos a democratização da ciência tornando os dados acessíveis. O resultado final da sua análise não é entregue
apenas em tabelas, mas disponibilizado no EncodeReports,
nossa plataforma de inteligência de dados desenvolvida in-house.
Figuras prontas para publicação: Gere gráficos interativos (PCoA, barplots, heatmaps) e exporte-os em alta resolução, prontos para a submissão do seu paper.
Estatística Integrada: Avaliação estatística robusta embutida na plataforma, permitindo comparar seus metadados dinamicamente.
Colaboração e Transparência: Compartilhe facilmente os resultados de forma segura com coautores e colaboradores de pesquisa.
Rastreabilidade e qualidade em cada etapa
1
Alinhamento científico
Nossa equipe alinha as perguntas biológicas do seu projeto e auxilia na organização dos metadados clínicos ou experimentais.
2
Upload Seguro
Transferência dos seus arquivos FASTQ, gerados no seu laboratório ou por terceiros, para nossos servidores seguros.
1
3
Processamento e Qualidade
Execução dos pipelines de bioinformática com rastreabilidade total, garantindo a reprodutibilidade metodológica exigida por revistas científicas.
4
Acesso aos Resultados
Liberação dos perfis taxonômicos e análises estatísticas diretamente no EncodeReports para sua exploração.
Eleve o impacto da sua pesquisa com análises de excelência
Transforme o desafio da análise de dados em clareza científica. Conte com a equipe multidisciplinar do nosso hub de inteligência para extrair o máximo potencial do seu sequenciamento e acelerar suas publicações.
*Obs.: Todos os dados genômicos e metadados clínicos são processados e armazenados sob rigorosos protocolos de segurança e confidencialidade, respeitando as boas práticas de pesquisa científica.
Perguntas frequentes
