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Garanta Dados de Alta Qualidade: O passo a passo para terceirizar análise de microbioma por NGS

Garanta a excelência técnica ao terceirizar sua análise de microbioma por NGS. Saiba quais critérios avaliar para escolher o parceiro certo e evitar erros que comprometem sua pesquisa.


Milena Moraes


Por Michelle Heck

Cientista de Alimentos, Doutora em Ciências dos Alimentos pela UFSC e Pesquisadora na BiomeHub.



Por Marina Veiga da Silva Amorim

Bióloga, Mestre em Neurociências e Assistente em Gestão de Projetos e Clientes na BiomeHub.





Neste postblog será abordado:



Tubos de amostras para serem sequenciadas

Quando terceirizar o sequenciamento de nova geração (NGS) em pesquisas clínicas.

A terceirização de sequenciamento de nova geração (NGS) em Projetos de Pesquisa Clínica com microbioma humano podem ser a chave para acelerar descobertas, reduzir custos e assegurar resultados de alta qualidade.


A tecnologia NGS para sequenciamento em larga escala está amplamente disponível, porém, não é comum que todos os grupos de pesquisa tenham infraestrutura adequada, equipe especializada ou tempo para execução das etapas laboratoriais necessárias e de análise dos dados.


Diante de um mercado com tantas opções, como tomar a melhor decisão?

Na BiomeHub, sabemos que confiar a análise de amostras à um parceiro externo exige segurança e transparência. Por isso, reunimos os principais pontos que devem ser considerados antes de escolher um prestador de serviços para sequenciamento NGS, com foco em amostras clínicas e pré-clínicas – e os sinais de alerta que não podem passar despercebidos.



Quais os benefícios de contratar um serviço especializado para análises do seu estudo de microbioma?

Investir em equipamentos, insumos, qualificação técnica e estrutura laboratorial para realizar análises em larga escala pode ser inviável para muitos projetos. Ao contar com um parceiro experiente, os pesquisadores podem acessar tecnologias de ponta, pipelines de bioinformática robustos e suporte técnico qualificado – sem sobrecarregar seus próprios recursos.

Nesse contexto, a contratação de um prestador de serviços em NGS surge como uma estratégia eficaz para garantir qualidade, agilidade e reprodutibilidade. Porém a escolha deve ser pautada por critérios técnicos bem definidos.


Com a escolha correta da empresa contratada, o pesquisador pode:

  • Acelerar a geração de dados com prazos previsíveis;

  • Garantir padronização e rastreabilidade em todas as etapas;

  • Otimizar recursos e tempo da equipe de pesquisa;

  • Obter dados confiáveis para análise ou submissão regulatória.


Na BiomeHub, os serviços para pesquisas com NGS de amostras clínicas e pré-clínicas são ofertados para projetos exploratórios, validação clínica ou estudos populacionais. Isso permite mais agilidade, flexibilidade e potencial de crescimento dos projetos.



O que avaliar antes de contratar um prestador de serviços em NGS?

1. Experiência com amostras clínicas e pré-clínicas:

A natureza das amostras utilizadas em estudos clínicos exige cuidados específicos desde a extração, preparo de bibliotecas e pipelines capazes de explorar o conteúdo com rigor e relevância clínica.

Neste sentido, é importante verificar se o prestador de serviço possui expertise com amostras de difícil extração, baixo rendimento e materiais biológicos de modo geral.


2. Controles de qualidade em todo o processo:

A confiabilidade dos dados depende da adoção de controles e padrões de qualidade em cada etapa: extração, preparo de biblioteca, sequenciamento e bioinformática. Um bom serviço deve documentar essas etapas e fornecer informações claras sobre a performance do experimento, como os número de reads, cobertura de sequenciamento, entre outros.


3. Pipeline bioinformática validado:

A análise dos dados é tão crítica quanto a geração dos mesmos. O prestador de serviço deve ser avaliado quanto à atualização dos pipelines utilizados, emprego de bases de dados reconhecidas, e se as análises são adequadas ao tipo de estudo desejado. Assim, os resultados esperados devem ser apresentados com relação à taxonomias, diversidade ou possíveis biomarcadores.

A BiomeHub, por exemplo, tem como entrega padrão um report descritivo com os principais indicadores obtidos por NGS. Além disso, pode oferecer relatórios analíticos customizados sob demanda.


4. Clareza na comunicação e suporte técnico:

É importante contar com um serviço que ofereça orientação técnica em momentos-chave do projeto. O suporte deve estar disponível para discutir o delineamento experimental, especificidades da amostra, limitações metodológicas e interpretação básica dos resultados. Tratando-se de pesquisas contendo amostras biológicas, a capacidade de orientar decisões técnicas, esclarecer dúvidas e responder rapidamente faz toda a diferença.


5. Histórico e reputação científica:

Um indicativo importante da confiabilidade e robustez dos métodos utilizados pode ser obtido checando experiências anteriores com projetos clínicos semelhantes ao que você deseja contratar, se houve colaboração com grupos de pesquisa reconhecidos e se possui histórico de contribuições em publicações científicas revisadas por pares.



Quais erros evitar ao escolher qual empresa vai analisar suas amostras?

  • Empresas com foco em amostras muito concentradas, sem suporte técnico adequado para casos com pouco material genético (baixa concentração/ low input) disponível.

  • Ausência de publicações ou validações anteriores – Um bom histórico de trabalhos publicados e feedbacks positivos de clientes é um indicativo de confiança.

  • Pouca documentação ou alterações não comunicadas no protocolo – A rastreabilidade e a padronização são fundamentais para assegurar a integridade dos resultados.

  • Promessas exageradas com entregas aquém do esperado – Transparência desde o início é essencial. Desconfie de promessas de prazos ou resultados pouco realistas.

  • Bioinformática limitada, sem transparência ou com pouco valor interpretativo.


Quando a bioinformática não é bem explicada, fica difícil entender como os resultados foram obtidos — o que compromete a confiança no estudo. A transparência na descrição dos métodos é essencial para garantir credibilidade.

A BiomeHub é especializada em projetos clínicos e pré-clínicos com foco em microbioma humano. Com uma estrutura completa para processamento de amostras clínicas e pré-clínicas com protocolos validados, rastreabilidade completa e suporte técnico próximo ao pesquisador.

Se você busca um serviço de confiança para seu projeto com sequenciamento NGS, estamos prontos para caminhar ao seu lado.


Nossa equipe está à disposição para entender as particularidades do seu estudo e oferecer uma proposta personalizada. Nosso compromisso é com a qualidade dos dados e a solidez científica dos projetos em que atuamos.




Está planejando um novo estudo com sequenciamento de nova geração?

Entre em contato com nosso time de pesquisa clínica e conheça nossas soluções.





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