O que significa genotipagem do HPV?
- Michele Patrícia Rode
- 24 de jul.
- 4 min de leitura
Entenda como o HPV é classificado em genótipos, a diferença entre genotipagem parcial e estendida e as vantagens do NGS na detecção do vírus.
Por Michele Rode
Farmacêutica, Doutora em Farmácia pela UFSC e Product Manager na BiomeHub.
Neste postblog será abordado:
O HPV (Papilomavírus Humano) é um vírus com mais de 200 genótipos. Cada tipo se comporta de maneira diferente no organismo: alguns causam lesões benignas, como verrugas genitais, enquanto outros estão associadas ao desenvolvimento de cânceres, especialmente o do colo do útero.
Saber qual genótipo de HPV está presente em uma amostra é essencial para o rastreamento eficaz, definição de risco e condutas clínicas individualizadas.
Neste post, você vai entender o que é genotipagem do HPV, como ela é realizada, quais as diferenças entre genotipagem parcial e estendida e por que tecnologias como o NGS (sequenciamento de nova geração) têm se destacado na identificação precisa dos genótipos
O que são genótipos de HPV?
Genótipos de HPV, ou tipos de HPV, são diferentes variantes genéticas do vírus, classificadas de acordo com sua sequência de DNA. Cada tipo recebe um número conforme a ordem de descoberta, por exemplo o HPV-16 foi descrito antes do HPV-45.
A classificação precisa dos tipos de HPV é fundamental para o rastreamento e a compreensão da epidemiologia. A classificação é baseada na análise da similaridade da sequência de nucleotídeos da região L1. Essa região é uma parte conservada do genoma do HPV que codifica uma proteína do capsídeo viral.
A classificação do HPV é baseada em algumas regras:
Diferentes gêneros de HPV possuem similaridade da sequência de nucleotídeos da região L1 menor que 60%.
Diferentes espécies de HPV possuem similaridade da sequência de nucleotídeos da região L1 menor que 70%.
Diferentes tipos (genótipos) de HPV possuem similaridade da sequência de nucleotídeos da região L1 menor que 90%.
O que significa genotipagem do HPV?
Realizar a genotipagem do HPV significa identificar os tipos específicos do vírus em uma determinada amostra.
A genotipagem do HPV permite a identificação de tipos oncogênicos (alta capacidade de causar câncer) diferenciando daqueles não oncogênicos que causam lesões como verrugas genitais.
Leia também: HPV: tipos, mecanismos e transmissão
Genotipagem parcial e estendida: entenda as diferenças
A genotipagem parcial e estendida são formas diferentes de identificar os tipos de HPV.
A genotipagem parcial detecta os dois tipos mais associados ao câncer (HPV 16 e HPV 18) de forma individual e agrupa os demais tipos oncogênicos em um único resultado, sem especificar cada um.
A genotipagem estendida identifica os tipos de HPV oncogênicos separadamente, agrupando os tipos por estratificação de risco. A utilidade clínica da genotipagem estendida está justamente na estratificação de risco. Por exemplo, estudos têm identificado que mulheres com HPV 31 têm um alto risco para NIC3 (neoplasia intraepitelial cervical grau 3) e podem necessitar colposcopia imediata. Por outro lado, a detecção do HPV-56, -59 ou -66 confere um risco baixo o suficiente para um rastreamento anual.
Metodologias de detecção do HPV
A identificação dos genótipos de HPV é importante para a saúde pública, pois direciona o desenvolvimento de vacinas, melhora o rastreamento, diagnóstico e manejo de lesões. O NGS, uma metodologia avançada de sequenciamento de DNA, permite a detecção de infecções múltiplas e dos tipos de HPV com alta precisão.
Principais vantagens do sequenciamento NGS para genotipagem de HPV:
Alto nível de especificidade: ao sequenciar a região L1, o NGS pode identificar de forma mais precisa tipos de HPV filogeneticamente próximos, como por exemplo os do grupo alfa-9 (HPV-31, -16 e -35).
Amplo espectro de detecção: identifica uma maior variedade de tipos de HPV otimizando a estratificação de risco de lesões.
Detecção de múltiplas infecções: permite identificar diferentes tipos de HPV na mesma amostra.
Prevenção: o NGS é essencial para monitorar o impacto da vacinação contra o HPV e acompanhar a prevalência dos genótipos circulantes.
Qual o impacto da microbiota vaginal?
Uma microbiota vaginal ideal é dominada por Lactobacillus, bactérias benéficas que mantêm o pH vaginal adequado, produzem moléculas antimicrobianas e fortalecem o sistema imune, protegendo contra infecções. A microbiota vaginal desequilibrada aumenta a suscetibilidade a Infecções Sexualmente Transmissíveis (IST), incluindo o HPV. Por exemplo, a Vaginose Bacteriana, um desequilíbrio comum da microbiota, está associada ao risco aumentado de infecções por HPV e de Neoplasia Intraepitelial Cervical (NIC).
A análise da microbiota vaginal pode fornecer informações importantes para um tratamento mais assertivo e individualizado. A análise da composição da microbiota vaginal e genotipagem do HPV podem ser feitas através do sequenciamento de DNA, como no exame BIOfeme Plus.
Ficou com alguma dúvida? Nossa equipe está aqui para ajudar! Entre em contato conosco e receba a ajuda que precisa.
Referências:
Diretrizes Brasileiras para o Rastreamento do Câncer do Colo do Útero: Parte I - Rastreamento organizado utilizando testes moleculares para detecção de DNA-HPV oncogênico. – Brasília : Ministério da Saúde, 2024.
Protocolo Clínico e Diretrizes Terapêuticas para Atenção Integral às Pessoas com Infecções Sexualmente Transmissíveis – IST [recurso eletrônico] / Ministério da Saúde, Secretaria de Vigilância em Saúde, Departamento de Doenças de Condições Crônicas e Infecções Sexualmente Transmissíveis. – Brasília : Ministério da Saúde, 2022.
WHO guideline for screening and treatment of cervical pre-cancer lesions for cervical cancer prevention, second edition. Geneva: World Health Organization; 2021.
McBride AA. Oncogenic human papillomaviruses. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2017 Oct 19;372(1732):20160273.doi: 10.1098/rstb.2016.0273.
Muñoz N, Bosch FX, de Sanjosé S, Herrero R, Castellsagué X, Shah KV, Snijders PJ, Meijer CJ; International Agency for Research on Cancer Multicenter Cervical Cancer Study Group. Epidemiologic classification of human papillomavirus types associated with cervical cancer. N Engl J Med. 2003 Feb 6;348(6):518-27. doi: 10.1056/NEJMoa021641.
Crow, J. HPV: The global burden. Nature 488, S2–S3 (2012). doi: 10.1038/488S2a
Levi JE, Martins TR, Longatto-Filho A, et al. High-Risk HPV Testing in Primary Screening for Cervical Cancer in the Public Health System, São Paulo, Brazil. Cancer Prevention Research. 2019;12(8):539-546. doi:10.1158/1940-6207.capr-19-0076
