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ANÁLISE DE
MICROBIOMA
VAGINAL

O Microbioma Vaginal é um ecossistema dinâmico e complexo, formado pela comunidade de microrganismos que habitam a vagina, bem como seus genomas e o ambiente em seu entorno. Possui grande importância na manutenção da saúde feminina e na proteção contra doenças.


Na BiomeHub possuímos experiência em projetos de análise de microbioma vaginal. 


Nossos processos são validados, desde a preparação de amostras até o sequenciamento e a entrega de dados, seguindo um rigoroso monitoramento da qualidade dos ensaios.

Pesquisas com microbioma vaginal podem incluir a investigação de:

Associações com o desenvolvimento de condições como, por exemplo, vaginose bacteriana, câncer cervical, endometriose, ISTs, infertilidade, aborto espontâneo e parto prematuro, entre outras.
Biomarcadores prognósticos.
Resposta a drogas.
Desenvolvimento de moléculas terapêuticas.
Estratégias de intervenção.

SERVIÇOS DISPONÍVEIS PARA PESQUISA DE MICROBIOMA VAGINAL

Aconselhamos sobre a melhor maneira de coletar, armazenar e enviar suas amostras. 

Realizamos extração de DNA de amostras de microbioma vaginal, sob condições controladas e rastreáveis.

Preparação das amostras

Veja os tipos de amostras aceitas

Material fornecido pela BiomeHub:

- Kit de coleta simplificado para Microbioma Vaginal

 

Material coletado pelo cliente:

- Amostra em solução PreservCyt (Hologic), ThinPrep (Hologic) ou Cell Preserv (Kolplast);

- OMNIgene VAGINAL (DNA genotek);

- Amostras de DNA já extraído*.

*Amostras de DNA já extraído devem ser preferencialmente congeladas (-20ºC a -80ºC), com concentração maior que 1 ng/uL (Qubit), em no mínimo 20 uL, com razão A260/280 entre 1.8 e 2.0, e sem EDTA no tampão de eluição.

Oferecemos sequenciamento de amplicons do gene 16S rRNA.

Sequenciamento

Amplicons do gene 16S rRNA

 

O sequenciamento de amplicon 16S rRNA é uma das aplicações mais amplamente utilizadas para investigar a microbiota em qualquer local do corpo.

 

Pode ser utilizado em pesquisas clínicas e pré-clínicas para:

  • Caracterização de populações bacterianas 

  • Análise taxonômica 

  • Identificação de espécies bacterianas 

Parâmentros do sequenciamento: o sequenciamento 16S (região V3-V4) é realizado usando a plataforma Illumina, single-end, com 300 pb.

Análises de dados: possuímos um pipeline de bioinformática para 16S, e os resultados liberados podem ser personalizados para atender às suas necessidades:

  • Dados brutos (fastq); 

  • Tabela com total de reads por classificação taxonômica;

  • Tabela de perfil microbiológico lowest (LCA);

  • Tabela com valores de alfa-diversidade;  

  • Tabela de contagem de oligotipos (ASV) e Tabela taxonômica;

  • Gráfico de perfil microbiológico; 

  • Gráfico de beta-diversidade; 

  • Sumário da análise.

Coleta de amostras